Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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