Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms