Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms