Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms