Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms