Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TROQ12816 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TROQ12816 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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