Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms