Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms