Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms