Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBP2P32456 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBP2P32456 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms