Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCP2P22307 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCP2P22307 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCP2P22307 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCP2P22307 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCP2P22307 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCP2P22307 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms