Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT13P13646 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT13P13646 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT13P13646 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT13P13646 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT13P13646 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT13P13646 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT13P13646 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT13P13646 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT13P13646 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT13P13646 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT13P13646 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT13P13646 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT13P13646 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT13P13646 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT13P13646 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT13P13646 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT13P13646 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT13P13646 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT13P13646 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT13P13646 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT13P13646 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT13P13646 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT13P13646 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT13P13646 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT13P13646 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT13P13646 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT13P13646 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT13P13646 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT13P13646 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT13P13646 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms