Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms