Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4Q9NRS4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms