Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms