Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SEMA3CQ99985 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SEMA3CQ99985 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SEMA3CQ99985 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SEMA3CQ99985 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SEMA3CQ99985 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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