Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

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Length 897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RBBP8Q99708 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RBBP8Q99708 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RBBP8Q99708 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RBBP8Q99708 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RBBP8Q99708 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RBBP8Q99708 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RBBP8Q99708 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RBBP8Q99708 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RBBP8Q99708 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RBBP8Q99708 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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