Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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