Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms