Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SORL1-206ENST00000527934 3032 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 EPS8L3-203ENST00000369805 2325 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GPATCH2L-209ENST00000556663 2112 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LILRB1-205ENST00000396331 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 FGF11-203ENST00000575082 2315 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 HIPK1-203ENST00000369553 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PIGO-201ENST00000298004 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MED29-207ENST00000615911 3565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC115102.1-201ENST00000558044 487 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms