Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms