Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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