Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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