Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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