Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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