Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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