Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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