Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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IKBKEQ14164 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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IKBKEQ14164 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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IKBKEQ14164 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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IKBKEQ14164 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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IKBKEQ14164 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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IKBKEQ14164 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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IKBKEQ14164 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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IKBKEQ14164 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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IKBKEQ14164 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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IKBKEQ14164 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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IKBKEQ14164 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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IKBKEQ14164 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IKBKEQ14164 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms