Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTP4A2Q12974 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTP4A2Q12974 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTP4A2Q12974 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTP4A2Q12974 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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