Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms