Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms