Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms