Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms