Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms