Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms