Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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PTPRMP28827 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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PTPRMP28827 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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PTPRMP28827 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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PTPRMP28827 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPRMP28827 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPRMP28827 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPRMP28827 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPRMP28827 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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