Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF4P18085 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF4P18085 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF4P18085 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF4P18085 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF4P18085 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF4P18085 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms