Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms