Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms