Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms