Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms