Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms