Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms