Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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