Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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