Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms