Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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RPE65Q16518 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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RPE65Q16518 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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