Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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