Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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