Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms